Genomic sequence analysis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 and search for possible medicines_West China Medical Journal

Authors：

SU Jialuo ^1,2 , WANG Kanghong ³ ,  DU Chenglin ¹

1. Institute of Materia Medica, Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Jinan, Shandong 250062, P. R. China;
2. School of Medicine and Life Sciences, University of Jinan, Jinan, Shandong 250000, P. R. China;
3. College of Life and Ocean Science, Shenzhen University, Shenzhen, Guangdong 518060, P. R. China;

Corresponding author：

DU Chenglin, Email: 371924408@qq.com

Keywords：

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2; Sequence analysis; Genome; Possible medicines

DOI：

10.7507/1002-0179.202002054

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Abstract Full text Figures/Tables Video References Cited by

The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 is characterized by a long incubation period, strong infectivity and general susceptibility to the population. At present, there are no specific medicines that can treat coronavirus disease 2019. In order to increase the understanding of the molecular biology of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 and try to find effective treatments, we used SnapGene Viewer to analyze the genomic sequences of five strains of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 that published by National Genomics Data Center. The results showed that the genome length of this virus was about 29.8 kb and twelve open reading frames were predicted, and five nucleotide change sites were found in the open reading frames. In addition, we analyzed drugs used during the outbreak of severe acute respiratory syndrome, current drugs for the treatment of coronavirus disease 2019 and other possible drugs, to find some possible medicines with clinical treatment effects.

Citation： SU Jialuo, WANG Kanghong, DU Chenglin. Genomic sequence analysis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 and search for possible medicines. West China Medical Journal, 2020, 35(3): 269-273. doi: 10.7507/1002-0179.202002054 Copy

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